Engenharia enzimática ou engenharia de proteínas é o processo de criação de proteínas ou enzimas alterando a sequência de aminoácidos por meio de mutação de DNA recombinante. Revolução dirigida e design racional são as duas técnicas usadas na engenharia enzimática ou no design de proteínas no processo de descoberta de medicamentos.
Enzimas são proteínas, a engenharia enzimática faz parte da atividade mais ampla da engenharia de proteínas. A engenharia enzimática utiliza tecnologia de DNA recombinante para introduzir as alterações desejadas nas sequências de aminoácidos das enzimas.
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